V návrhu smlouvy o kontrolní činnosti je cena za certifikaci (obvykle za tříleté období platnosti certifikátu) rozložena do tří plateb (certifikace/recertifikace, první dozor , druhý dozor). Částky jsou fakturovány až po provedení auditní návštěvy.
Cena za certifikační řízení se odvozuje z řady faktorů jako:
- typ certifikačního řízení (prvotní certifikace, opakovaná certifikace, dozory)
- druh systémů managementu (QMS, EMS, SM BOZP …) a rozsah jejich zavedení,
- stupeň integrace systémů managementu,
- počet zaměstnanců certifikované organizace,
- počet požadovaných činností, uvedených na certifikátu,
- velikost a počet pracovišť a jejich geografické umístění,
- náročnost oboru (komplikovanost návrhu, složitost výroby nebo poskytovaných služeb, technologický a právní kontext, rizika provozu, počet a závažnost environmentálních aspektů, aspekty bezpečnosti práce, apod.),
- směnnost provozu,
- stupeň připravenosti organizace,
- náklady na přepravu týmu auditorů na místo auditu,
- poplatky certifikačního orgánu za akreditaci a witness audity,
- administrativní, provozní a další interní náklady certifikačního orgánu,
- průměrná velikosti roční inflace v ČR,
- aj.
Z uvedeného důvodu je konkrétní cena ze certifikační řízení stanovena vždy individuálně u každé certifikované organizace zvlášť.